例えばRADIUS認証などのセキュリティ対策を実施するとセキュリティレベルは高くなりますが、導入コストだけでなく運用コストも高くなることが想定されます。運用時にどのような作業が必要となるかも、あわせて考慮が必要です。1つの対策だけでなく代替手段も検討し、導入・運用のコストやセキュリティのレベル、セキュリティインシデントの発生リスク、対応コストを比較することお薦めします。セキュリティ対策については専門性が高いため、必要に応じて業者にご相談ください。
基本的には、端末が接続する先のWEB APサーバ上に非公開情報(個人情報等)が含まれているのであれば導入した方がよいかと思いますが、校務系と学習系が分離されており、学習系に非公開情報が含まれていないのであれば導入の優先度としては低くなるのではないかと思います。この場合、セキュリティとしてはSSIDのステルス化・パスワードの非公開化・Macアドレス認証程度で良いと思われます。